1913年，林祖密獲得中國國籍，歸籍證號碼為許字第一號，證書上寫著：“內(nèi)務(wù)總長為許可事茲據(jù)，日本臺籍人林季商依中華民國國籍法及施行規(guī)則呈請復(fù)籍，核與本法及施行規(guī)則相符，合行許可，發(fā)給執(zhí)照為憑�！弊耘_灣割日以來，臺灣仕民內(nèi)渡者中，正式取得中華民國國籍者，林祖密成為第一人。
改籍后，林祖密穿梭往返于漳州、廈門等地，從事革命活動及地方實業(yè)建設(shè)。孫中山先生聽說林祖密有志于革命，且在閩臺頗有聲望，遂派人向他講述革命救國大義，希望他支持國民革命。林祖密隨即加入中華革命黨，追隨孫中山先生。在袁世凱竊國稱帝時，林祖密還曾捐銀十萬兩作軍餉，并召集漳、泉有志之士積極倒袁、繼續(xù)革命，直至后來被地方軍閥殺害，年僅48歲。
臺灣義士丘念臺(丘逢甲之子)曾撰文贊揚道：“革命不難，舍富貴而革命為難；舍富貴而革命不難，能審國族、辨忠節(jié)，而舍富貴以革命為尤難。臺灣林祖密者，乃能此尤難者也�！比缃�，林家后人開枝散葉在世界各地，宮保第已無林氏族人居住，但這里仍是牽系林氏家族以及兩岸特殊情緣的紐帶。（陳夢婕）
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